Laut ÖFB-Satzungen hat das Präsidium für besondere Aufgaben Kommissionen zu bestellen und deren konkrete Tätigkeitsbereiche festzulegen. Seit der letzten Hauptversammlung des ÖFB am 30. Mai 2010 in Tirol (Mayrhofen im Zillertal) gibt es insgesamt vier Kommissionen, wobei der Sportkommission  noch auf Vorschlag des ÖFB und der Österreichischen Fußball-Bundesliga externe Experten zur Seite gestellt werden.

Den jeweiligen Kommissionen sind diverse Komitees unterstellt. Diese sind bei

Sportkommission: Komitee Sportmedizin und Anti-Doping (Vorsitz Dr. Sepp Geisler), Komitee Traineraus- und -fortbildung (Vorsitz Karl Kaplan), Komitee Spitzennachwuchs (Vorsitz Willi Prechtl), Komitee Breiten- und Trendfußball (Vorsitz Werner Lippitz), Komitee Frauenfußball (Vorsitz Johann Gartner)

Schiedsrichterkommission: Komitee Bundesliga/Elite (Vorsitz Johann Hantschk), dazu gibt es noch das Komitee Schiedsrichterforum, sowie die unterstellten Ausschüsse für Schiedsrichter-Rekrutierung, Beobachtungswesen und FIFA-Spielregelung/Aus- und Weiterbildung

Kommission für Recht/Administration: Komitee Spielervermittler/Spielvermittler (Vorsitz Dr. Sepp Geisler), Komitee Bestimmungen (Vorsitz Willi Prechtl), Komitee Rechtsfragen und EU-Recht (Vorsitz Dr. Herbert Hübel), Komitee Steuerrecht (Vorsitz Dr. Horst Lumper), Komitee Cup-Bewerbe (Vorsitz Robert Sedlacek)

Kommission für Finanzen/Organisation: Komitee Spielorganisation (Vorsitz Robert Sedlacek), Komitee Stadien und Sicherheit, Komitee Fanprojekt (Vorsitz Michael Zoratti)